凝胶色谱法又叫凝胶色谱技术，又称分子排阻色谱法，其分离物质的原理为分子筛原理,且多用于分离有机大分子化合物,如蛋白质、多肽、多糖等。
凝胶色谱与凝胶层析基本上是一致的只是固定相存在差异。凝胶层析又称分子筛过滤、排阻层析，操作条件比较温和，可在相当广的温度范围下进行，并且对分离成分理化性质的保持有独到之处。两者的共同点是都不需要有机溶剂。凝胶色谱色谱一般用在HPLC等分析场合。而凝胶层析一般用在制备的时候。
凝胶色谱法和电泳的区别是什么？
凝胶色谱法又称分子排阻色谱法。分离依据是目的物分子量的大小。主要用于高聚物的相对分子质量分级分析以及相对分子质量分布测试。形象来说更像是“分子筛”。大分子物质先流出，小分子物质后流出。
凝胶电泳的原理比较简单。当一种分子被放置在电场当中时，它们就会以一定的速度移向适当的电极，这种电泳分子在电场作用下的迁移速度，叫做电泳的迁移率。它同电场的强度和电泳分子本身所携带的净电荷数成正比。也就是说，电场强度越大、电泳分子所携带的净电荷数量越多，其迁移的速度也就越快，反之则较慢。由于在电泳中使用了一种无反应活性的稳定的支持介质，如琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺胶等，从而降低了对流运动，故电泳的迁移率又是同分子的摩擦系数成反比的。已知摩擦系数是分子的大小、极性及介质粘度的函数，因此根据分子大小的不同、构成或形状的差异，以及所带的净电荷的多少，便可以通过电泳将蛋白质或核酸分子混合物中的各种成分彼此分离开来。形象来说更像是“马拉松”。不过影响因素不仅仅是分子量了。
